Más de 200.000 personas han huido a Sudán del Sur a consecuencia del conflicto entre el Movimiento de Liberación Popular de Sudán–Norte (SPLM–N) y las fuerzas armadas sudanesas. La mayoría de estos refugiados vive hoy en los estados sursudaneses de Unidad y Alto Nilo. Eso supone un gran reto para las regiones afectadas. En algunas zonas, el número de refugiados triplica al de la población local y la presión sobre los recursos, que ya eran escasos antes, como la madera, el agua y la tierra de cultivo, se ha incrementado. Esta situación a menudo ocasiona tensiones y conflictos entre los refugiados y la población local.
La COSUDE ayuda al Alto Comisionado de las Naciones Unidas para los Refugiados (ACNUR) a prevenir o revertir los efectos negativos de la sobreexplotación de los recursos naturales en Sudán del Sur. A medio plazo, se implementará una estrategia para monitorear los impactos ambientales de los campos de refugiados en los estados de Unidad y Alto Nilo. Como parte de estos esfuerzos, la COSUDE ha financiado desde junio de 2013 hasta finales de marzo de 2015 un proyecto para elaborar una cartografía forestal de los condados sursudaneses de Maban (Alto Nilo) y Pariang (Unidad) mediante imágenes satelitales.