I comitati misti curano l’attuazione degli Accordi bilaterali. Sono composti da rappresentanti della Svizzera e dell’UE e adottano decisioni di concerto unicamente nei casi contemplati dai trattati interessati. Esiste un comitato misto per ciascun accordo bilaterale, ad eccezione degli accordi che disciplinano l’assistenza amministrativa, come quelli relativi allo scambio automatico di informazioni (SAI) e alle pensioni.
A questi comitati misti spetta il compito di assicurarsi che gli accordi vengano attuati correttamente. Sono incaricati segnatamente di adattare gli accordi nei limiti delle rispettive competenze. Essi permettono inoltre di scambiarsi informazioni tra la Svizzera e l’UE e di comporre eventuali controversie. In linea di massima, i comitati misti si riuniscono una volta all’anno.