La Suisse a reconnu l’indépendance du Tadjikistan le 23 décembre 1991, après l’effondrement de l’Union soviétique. Les deux pays ont établi des relations diplomatiques le 9 décembre 1992. Relevant dans un premier temps de l’Ambassade de Suisse à Moscou, elles ont été confiées, à partir de 1994, à l’Ambassade de Suisse à Tachkent (capitale de l’Ouzbékistan). Depuis 2008, elles relèvent de la compétence de l’Ambassade de Suisse à Astana (capitale du Kazakhstan).
La Suisse a ouvert un bureau de coopération à Douchanbé en 1998.
L’engagement de la coopération internationale de la Suisse au Tadjikistan remonte à la mission d’aide humanitaire mise en place en 1993 pendant la guerre civile. Depuis 1997, le Tadjikistan fait partie du groupe de vote présidé par la Suisse au sein des institutions de Bretton Woods.
Le Tadjikistan a décidé en 2007 d’élever son bureau de Genève au rang de mission. Depuis 2011, il dispose d’un ambassadeur accrédité en Suisse.
Tadjikistan, dictionnaire historique de Suisse